Jojo Rabbit est adapté du roman Le Ciel en cage de Christine Leunens publié en 2004. C’est par sa mère, une Néo-Zélandaise dont la famille juive russe a émigré au début des années 1900, que Taika Waititi a découvert le livre.
Le réalisateur a injecté dans cette histoire grave et sérieuse la tonalité comique de son univers. « Dans les films de Taika, le rire n’est jamais gratuit. Il y a des conséquences. Même si vous ne les voyez pas tout de suite, vous les sentirez. Il titille votre conscience », explique Christine Leunens.